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α亚基包含两个球形结构域，N端结构域和C端结构域，这两个结构域之间几乎没有相互作用，其各自都可以独立正确折叠。α亚基被认为是eIF2中的调节亚基。它是磷酸化调控的主要对象，即对位于51位的丝氨酸（Ser51）进行磷酸化，而α亚基的磷酸化形式能够调节eIF2B的活性。N端结构域上还含有一个S1亚结构域，可能为RNA结合位点。

β亚基也含有多个磷酸化位点（2, 13, 67, 218位上的氨基酸残基）。它的N端结构域还含有3个赖氨酸聚集的区域，是与eIF5结合的重要位点。C端结构域含有eIF2B的结合区和一个预测的锌指花样区，其中锌指花样参与了TC和43S前起始复合物的形成。它还含有两个保守的鸟苷酸结合区，但不参与eIF2的活性的调控。β亚基还被认为能够结合tRNA和mRNA。

γ亚基含有属于GTP酶，其作用是结合GTP和Met-tRNAi，并在eIF5的激活下，将eIF2结合的GTP水解为GDP。它含有三个保守的鸟苷酸结合区，是GTP/GDP的主要结合位点。它还含有一个tRNA结合凹槽和Zn2+离子结合位点。

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指南溪，亦称醉梦溪、无名溪，台湾景美溪支流，自大坑溪与小坑溪汇流而成，位处台北市文山区。上游流域为猫空山区，发源于海拔678公尺之二格山北坡，流向东北并流经国立政治大学校区，最后注入景美溪。

指南溪长约6公里，源头至河口落差超过650公尺，坡度甚陡下蚀力强，中上游河谷深峻，为景美溪最长的支流。而沿溪有许多珍贵自然生态，如丘陵地带珍贵次生林等。北政桥北岸有小坑溪汇入，南岸在猫空、樟湖、石狮脚各有一条小支流由南向北汇入指南溪，两岸山谷有环形产业道路通达各茶园，为重要茶产区，土壤裸露易崩塌流失。指南宫位于北岸与小坑溪之间的分水岭上。

醉梦溪系由政治大学新闻系的学生为这条无名溪命名。醉梦溪原流经政治大学校园，该校山下校区便位于其冲积扇。后经河川截弯取直工程后绕出校园汇入景美溪，右岸为政大校区，左岸为该校后山。

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