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1922年回国担任国立东南大学(1928年改名国立中央大学,1949年改名南京大学)生物系教授,1926年起担任清华大学生物系教授兼系主任,1927年任北京师范大学生物系教授,1928年任中央大学教授。1929年至1937年担任清华大学生物系教授兼系主任,1938年至1946年担任西南联合大学教授,1946年起复任清华大学生物系教授兼系主任,其间曾于1947年兼任联合国教育科学文化组织中国委员会第一届委员。1948年,当选为中央研究院第一届院士。
1949年中华人民共和国成立后,他续任于清华大学生物系。1952年清华大学生物系并入北京大学,他担任合并后的北京大学生物系教授,并兼任中国科学院动物标本工作委员会主任委员。1953年起担任中国科学院动物研究室主任,1955年获选为中国科学院院士(学部委员),1957年动物研究室改制为动物研究所,由他担任所长。同年11月病逝于北京。
他长期投入于金鱼遗传与变异、动物行为学、生物学史等研究工作,是中国较早的现代生物学者及教育家,也是中国动物遗传学的创始人。
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南宁理工学院是位于广西壮族自治区的一所民办本科学院。
该院创办于2002年4月,是经教育部批准,以新机制(北京北方投资集团)创办、独立设置的全日制本科普通高校。学校,占地700余亩,规划总建筑面积48万平方米。拥有现代化的教学楼,功能先进的实验室、实训室;设施完备的宿舍楼、食堂、体育场馆,环境优雅、生活便利。
2002年4月,桂林理工大学博文管理学院成立。
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郭军城晚年大部分时间在中国内地教球,间中亦有回香港参加比赛,2009年获得香港比力公开赛季军。
2011年3月11日晚上,郭军城与太太从陕西乘坐火车到广州途中,怀疑心脏病发,在广州一间医院送院后证实不治,享年59岁。
* 亚洲桌球锦标赛冠军 一次(1985年)
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